武藏野市内有吉祥寺、三鹰、武藏境JR中央线3个车站，此外，从吉祥寺车站可以连接到京王电铁井之头线，从三鹰车站可以乘坐JR总武线、东京METRO东西线，在武藏境车站可以连接西武多摩川线，这里铁道网极为发达，具有交通便利的区位优势。

此外，在市内运营着MU大巴、关东大巴、小田急大巴、京王大巴、西武大巴等各种线路的公交路线，武藏野市几乎全部区域都可以被大巴路线覆盖。